本種について、新「日本の野生植物」には掲載がありません。
おそらくですが、カヤツリグサ科の権威であり、元・国立科学博物館の大井先生の見解を踏襲し、ホタルイと区別できないとしたものと思われます。

が、近年、イヌホタルイは2n=74、ホタルイは2n=42 or 44 と報告されており、シカクホタルイ(※)の分類学的研究(2015.9 植物地理63 織田・永益)では「イヌホタルイとホタルイは別種である」と結論づけています。

何が正しいのか、筆者には正しく判りませんが、上記論文に従い、別種としました。(甚だいい加減だとは思いますが・・・)

なお、この他に、イヌホタルイはホタルイが田んぼのような人工環境に適応した変種であるという説もあるそうです。
いずれにしろ、有識者の間で見解が一致していない種であることは間違いないようで、今後再び変更されることがあるかもしれないと思います。

※　シカクホタルイ (サンカクホタルイ) = カンガレイ x ホタルイ